2015年起，他指使下属采取虚构工程项目的方式，伪造工程合同及验收报告，并令人冒用他人身份先后注册成立了两家“皮包”公司，专门用于虚开建筑类发票，总共套取财政和扶贫发展专项资金518万余元，其中扶贫资金90余万元。在套取资金的同时，他还以乡财政资金困难为由，13次从乡代理办违规挪用村级集体资金和村民互助资金435.2万元，其中最多一次，挪用资金高达80万元。

2018年1月3日，第四次庭审在南安市法院进行。庭审现场，李耀东当庭承认，在2014年期间分别收受过10万元现金、5张提酒卡和1万购物卡。

《晒浴霸、穿毛衣……动物园怕冷动物过冬有"神器"》起诉书中称，2013年至2014年期间，被告人李耀东利用担任中信银行泉州分行行长的职务便利，非法收受邱辉足、洪金山、王荣平、许金岑、施纯锡、王育云、李桂真、苏清阅、丁思强、林世钢等人的贿赂累计人民币305万、港币30万元（折合人民币235782元）、美金2万元（折合人民币122886元）、路易十三洋酒提酒卡5张（无法找到销售提酒卡商店，无法确定价值），在审核审批相关企业申请贷款、续贷或增加授信额度的过程中，为上述人员谋取利益。