在民进党的追杀下，国民党党工一度面临“断炊”危机，每月国民党党工薪水的按时发放成为国民党的一大难题。前国民党主席洪秀柱为了发薪，曾想过要把自己的房子卖掉，现任国民党主席吴敦义则被曝每个月都需要借钱才能给党工发薪。

在移民和难民政策以及其他多个领域，联盟党内部偏保守的基社盟与社民党的意见更是明显相左。基社盟一直“反对难民家庭团聚”，“主张增加国防预算”以及“有限度的”欧洲一体化进程，主张收回社民党的教育改革计划等。

《长这样!中国研究团队在南海首次发现神秘喙鲸》试探性谈判结束后，联盟党和社民党将根据党内意见，决定是否进行正式组阁谈判以达成联合组阁协议，而且这一协议最终也需获得两党党内同意。